El Departament de Patrimoni Històric i Museus vetlla per la conservació, preservació, recuperació i divulgació del patrimoni cultural, històric, arquitectònic i arqueològic del municipi. Les principals tasques que desenvolupa són les següents:
- Vetlla pel compliment i l’aplicació al municipi de la Llei 9/1993 de 30 de setembre del Patrimoni cultural català i de la resta de la legislació vigent en matèria de patrimoni cultural.
- Gestiona, desenvolupa, impulsa, promou i col·labora en projectes i accions d’investigació, de restauració-conservació, de rehabilitació i de recuperació d’elements del patrimoni històric, arquitectònic i arqueològic del municipi.
- Col·labora amb institucions, particulars, entitats, centres acadèmics i culturals per a la realització de projectes d’investigació, de restauració-conservació, de rehabilitació i de recuperació d’elements del patrimoni històric, arquitectònic, arqueològic i literari del municipi.
- Gestiona i promou les campanyes d’intervenció arqueològica preventiva o dins de projectes de recerca en jaciments arqueològics del municipi.
- Gestió de les sol·licituds de subvencions i ajudes econòmiques d’administracions públiques (Departament de Cultura, OSIC, Generalitat de Catalunya, Diputació de Girona, Ministerio de Cultura, FEDER de la UE) o privades en matèria de patrimoni cultural, històric i arqueològic.
- Atén les demandes i peticions d’informació i assessorament dels veïns, veïnes, interessats, estudiants i investigadors en temes de patrimoni cultural, històric, arquitectònic i arqueològic.
- Gestió del Museu d’Història Medieval de la Cúria-Presó, s. XIV.
- Gestió del dipòsit arqueològic municipal.
- Responsable de la conservació, preservació i restauració del fons històric i arqueològic municipal.
- Organització d’activitats, accions, jornades, seminaris, simposis, conferències, exposicions al voltant del patrimoni cultural i històric local.
- Coordinació d’activitats, accions, jornades i projectes i col·laboració amb els equipaments museístics del municipi: Basílica de Santa Maria, Ecomuseu-Farinera i Sinagoga del Puig Mercadal.
- Gestió i seguiment dels convenis de col·laboració amb institucions públiques, acadèmiques i universitàries en matèria de realització i desenvolupament de projectes de recerca, difusió i gestió del patrimoni cultural i històric local.
- Realització de projectes de senyalització patrimonial del municipi.
- Col·laboració en el Pla Educatiu d’Entorn (PEE) i amb els centres educatius per a la promoció del coneixement i la sensibilització vers el patrimoni cultural i històric del municipi.
- Direcció i gestió del Centre d’Estudis Trobadorescos.
- Col·laboració amb el Departament de Cultura i Festes i amb la Coordinadora Municipal del Festival Terra de Trobadors en l’organització del Festival Terra de Trobadors.
- Organització de la Beca Jeroni Pujades de Recerca Històric de l’Ajuntament de Castelló d’Empúries.
- Col·laboració amb el Departament de Turisme en la promoció del patrimoni cultural i històric local.
- Gestió i desenvolupament de projectes de col·laboració transfronterera amb el suport del FEDER (TERTROB EFA 172/11).
- Gestió del Servei de publicacions de l’Ajuntament de Castelló d’Empúries.
- Comissariat de l’Any Carles Fages de Climent.